按照《伯吉氏系统细菌学手册》第二版第二册(2005年),多杀性巴氏杆菌在分类上属巴氏杆菌目、巴氏杆菌科、巴氏杆菌属。巴氏杆菌科包括6 个属,依次为巴氏杆菌属、放线杆菌属、嗜血杆菌属、曼氏杆菌属、隆派恩杆菌属、海豚杆菌属。