1 试剂
1.1 消化液
1.1.1 1M 三羟甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)(pH8.0)
三羟甲基氨基甲烷 12.11 g
灭菌双蒸水 80 mL
浓盐酸 调pH 至8.0
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.1.2 0.5M 乙二胺四乙酸二钠(EDTA)溶液(pH8.0)
二水乙二胺四乙酸二钠 18.61 g
灭菌双蒸水 80 mL
氢氧化钠 调pH 至8.0
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.1.3 20%十二烷基磺酸钠(SDS)溶液(pH7.2)
十二烷基磺酸钠 20 g
灭菌双蒸水 80 mL
浓盐酸 调pH 至7.2
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.1.4 消化液配制
1 M 三羟甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)(pH8.0)2 mL
0.5 mol/L 乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)0.4 mL
20% 十二烷基磺酸钠溶液(pH7.2)5 mL
5 M 氯化钠 4 mL
灭菌双蒸水 加至200 mL
1.2 蛋白酶K 溶液
蛋白酶K 5g
灭菌双蒸水 加至250 mL
1.3 酚/氯仿/异戊醇混合液
碱性酚 25 mL
氯仿 24 mL
异戊醇 1 mL
1.4 2.5 mmol/LdNTP
dATP(100 mmol/L)20 μL
dTTP(100 mmol/L)20 μL
dGTP(100 mmol/L)20 μL
dCTP(100 mmol/L)20 μL
灭菌双蒸水 加至800 μL
1.5 8pmol/μL PCR 引物
上游引物ATXU(2 OD)加入701 μl 灭菌双蒸水溶解,下游引物ATXD(2 OD)加入697 μL 灭菌双蒸水溶解,分别取ATXU、ATXD 溶液各300 μL,混匀即为8 pmol/μL 扩增引物。
1.6 0.5单位Taq DNA 聚合酶
5 单位Taq DNA 聚合酶 1 μL
灭菌双蒸水 加至10 μL
现用现配。
1.7 10×PCR 缓冲液
1.7.1 1 mol/L 三羟甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)(pH9.0)
三羟基甲基氨基甲烷 15.8 g
灭菌双蒸水 80 mL
浓盐酸 调pH 至9.0
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.7.2 10 倍PCR 缓冲液
1 mol/L 三羟基甲基氨基甲烷-盐酸(Tris-HCl)(pH9.0)1 mL
氯化钾 0.373 g
曲拉通X-100 0.1 mL
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.8 溴化乙啶(EB)溶液
溴化乙啶 0.2 g
灭菌双蒸水 加至20 mL
1.9 电泳缓冲液(50 倍)
1.9.1 0.5 mol/L 乙二胺四乙酸二钠(EDTA)溶液(pH8.0)
二水乙二胺四乙酸二钠 18.61 g
灭菌双蒸水 80 mL
氢氧化钠 调pH 至8.0
灭菌双蒸水 加至100 mL
1.9.2 TAE 电泳缓冲液(50 倍)
三羟基甲基氨基甲烷(Tris)242 g
冰乙酸 57.1 mL
0.5 mol/L 乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)100 mL
灭菌双蒸水 加至1 000 mL
用时用灭菌双蒸水稀释使用
1.10 1.5%琼脂糖凝胶
琼脂糖 3 g
TAE 电泳缓冲液(50 倍)4 mL
灭菌双蒸水 196 mL
微波炉中完全融化,加溴化乙啶(EB)溶液20 μL。
1.11 上样缓冲液
溴酚蓝0.2 g,加双蒸水10 mL 过夜溶解。50 g 蔗糖加入50 mL 水溶解后,移入已溶解的溴酚蓝溶液中,摇匀定容至100 mL。
1.12 其他试剂
异丙醇(分析纯)
70%乙醇
15 mmoL/L 氯化镁
灭菌双蒸水