基因组和蛋白质组

三、基因组和蛋白质组

该病毒有2 种病原,即狷羚属疱疹病毒I 型和绵羊疱疹病毒2 型,基因组为双股线状DNA 分子。目前已成功获取狷羚属疱疹病毒I 型的WC11 分离株以及强毒C500 株基因序列。WC11 分离株为基因组部分序列,强毒C500 则是完整基因组,约130 608 bp,预测有多个蛋白编码区,占基因组的60%以上。绵羊疱疹病毒2 型基因组约130 930 bp,含有73 个开放阅读框架,G+C 含量平均为52%。基因组两端重复序列长达4 205 bp,在这一区域,G+C 含量平均为72%。目前建立的PCR 方法多数针对病毒保守的TK、gB、gC、gD 和gE 等基因。