牛病毒性腹泻黏膜病主要病变在消化道，软腭、舌、食管、胃及肠黏膜充血、出血、糜烂、坏死。腹股沟淋巴结、肠系膜淋巴结水肿、发紫，切面呈红色。肝脏、胆囊肿大。肾包膜易剥离，皮质有出血点。肺充血、肿大。全身淋巴结肿大。严重病例在咽喉部黏膜有溃疡及弥散性坏死，最具特征的病变是食管黏膜糜烂。
