条贯《伤寒论》，辨析发明仲景论治伤寒微言大义
多数学者认为伤寒学派肇始于明代方有执，大体以错简重订、维护旧论、辨证论治三家为主要流派，尤在泾则属于辨证论治流派。其特点在于：不仅强调仲景的立法，更突出治法，不以风伤卫、寒伤营等经文印定眼目。尤氏认为张仲景立说本旨在于辨证论治，祛病活人，《伤寒论》全书精要是其理法，不必孜孜于文字编排之间，精要之处在于需要强调实用，重视治法。
首先，尤氏之《伤寒贯珠集》开创了以法类证的先河。尤怡从临床实际出发，以辨证施治为原则，将《伤寒论》原文重新编次，并适当糅合《金匮要略》的有关条文，以六经分篇，每经首列条例大意，以阐明本经证治之大要。经下统法，此类大法为证治之要，如太阳之正治、权变、斡旋、救逆诸法。法下又赅方证，如太阳篇之麻黄汤、桂枝汤类，阳明篇之承气汤类等，再下层则列诸证，证随方出。对法、证的排列组合，则是遵循先主法主证，后变法变证，最后为类证的原则。如此方随法出，证随方出，环环相扣。这样划分编排最大的好处是突出治法，纲目明了，便于掌握及临床应用。正如尤氏书中所言：“略引大端于前，分列纲目于后，而仲景之法方，周不备举……千头万绪，总归一贯，此于百八轮珠，个个在手矣。”
以下以太阳一病说明之：太阳一经，下分五法，太阳经原发之病和正治之法归为“正治法”。实际上就是太阳经证中风、伤寒以及太阳与他经合病之证，审其汗之有无、脉之缓急，或合阳明，或合少阴，分别用麻黄汤、桂枝汤、葛根汤、黄芩汤等，而照顾到病者内因不同、体气虚实、脏腑阴阳、素体有痰饮、痞气、咽、淋、疮、衄、血、汗等疾或病后产后等差异，所患伤寒亦不能一概而论，需分别情况用小建中、复脉、大小青龙、桂二麻一等方，体现了“因人制宜”的原则，归结为太阳“权变法”。在辨治太阳证过程中，如果出现了太过或不及，如发汗不彻、邪不外散而致病情不解，或发汗太过，过犹不及，亦能伤阴伤阳导致人为变证。为了御变而设更发汗、更药发汗、真武汤、四逆汤等法方从中斡旋调停，是为太阳“斡旋法”。临病对证，辨识不清，对法方掌握失当，以致汗下妄施、温灸混用，治疗结果适得其反，出现种种坏证、逆证，如结胸、痞证、协热下利、惊狂不安等，相应有陷胸、泻心、芩连葛根汤等补救措施，为太阳“救逆法”。又有风温、温病、中暍、霍乱等病与伤寒相似而实不相同，俱列篇中，配以相应法方，示医者于相似中求出不似，以资鉴别，为太阳“类病法”。
其他五经也仿照太阳的体制，阳明经有正治法、明辨法、杂治法；少阳经有正治法、权变法、刺法；太阴病有温里法、解表法、先里后表法；少阴清法、急下法、温法、辨生死法、病禁；厥阴清法、温法、厥阴进退之机、生死微甚等辨。(https://www.daowen.com)
其次，尤氏注重从经络、脏腑的角度来阐发六经证候。自宋朝朱肱提出六经经络说、传足不传手以来，医家们就伤寒六经问题展开了争论，有经络说、脏腑说、气化说、部位说、疆界说等。尤怡在《伤寒贯珠集》中，将三阳经病证分为经病、腑病，将三阴经病证分为经病、脏病，说明尤怡是以经络、脏腑解释伤寒六经的。如在太阳病正治法第一条注文中尤氏指出：“人身十二经络，本相联贯，而各有畔界，是以邪气之中，必各有所见之证与可据之脉。仲景首定太阳脉经，曰脉浮头项、强痛、恶寒。盖太阳居三阳之表，而其脉上额交巅，入络脑，还出别下项……”在太阳斡旋法太阳传本证治注释中说：“脉浮小便不利，微热消渴者，病去标而之本，为膀胱腑热证也。”又如在少阳正治法柴胡汤主证条注解中有：“胸胁苦满者，少阳之脉，其直者从缺盆下腋循胸过季胁故也。”太阳篇首云：“太阳者，土也。在脏为脾，在气为湿。伤寒传经之热入而与之相搏，则为腹满吐利等证。”等等。
同时，尤怡还对伤寒之“三纲鼎立”学说做了修正与发展。自晋王叔和提出“风伤卫，寒伤营”之后，药王孙思邈于太阳表证提出“一则桂枝，二则麻黄，三则青龙，凡疗伤寒，此之三方，不出之也”。此后又经宋代许叔微、金代成无己两位医家发展丰富，再经明代方有执、喻嘉言最终发展成熟为伤寒“三纲鼎立”之说，成为错简重订派的主要观点之一。按照伤寒分立三纲，风伤卫则用桂枝汤，寒中营则用麻黄汤，风寒两伤营卫则用大青龙汤。至清代，该学说广为流行。但尤怡从临证实际情况出发，于其注文中大力反驳此说。他认为“桂枝主风伤卫则是，麻黄主寒伤营则非。盖有卫病而营不病者，未有营病而卫不病者”。寒邪侵犯太阳肌表，因其性属阴，功主收引、凝滞，是故足以外闭卫阳而内郁营血。且腠理受寒关闭而至无汗为表实之证，又怎么能说是卫虚！麻黄为去表实之药，如何单单遗漏卫分！所以，麻黄汤所主病证于尤氏看来实为“营卫并实”，即所谓“风寒两伤营卫”而非营实卫虚之证。
关于仲景原文所提到的营弱卫强之说，尤氏认为仲景之说不过是想说明太阳中风发热汗出的原因罢了，后人不细细探究，而致力于“炫新说而变旧章”，以致错误地认为“风并于卫，则卫实而营弱；寒中于营，则营实而卫虚”，却不曾留心风寒邪气伤人，皆自皮毛而入于肌肉。卫分较之营分为表浅，其主要生理功能为卫外而兼温分肉，充皮肤，肥腠理，司开合之职，其性属阳，所以无论中风还是伤寒，都会伤及卫分，只有风寒邪气达到一定程度才会伤及营分，正如注文中提到的“寒之浅者，仅伤于卫；风而甚者，并及于营。卫之实者，风亦难泄；卫而虚者，寒犹不固”。所以对于表实无汗之太阳伤寒，用辛温发汗之麻黄汤去其表实而发散邪气；对于表虚有汗之太阳中风，用解肌发表调营卫的桂枝汤，助表气而逐邪气！关于如何判断该用麻黄汤还是桂枝汤，尤氏说道：“但当分病证之有汗无汗，以严麻黄、桂枝之辨；不必执营卫之孰虚孰实，以证伤寒之殊。”
还有，尤氏创立了六经俱能感受寒邪的理论。尤氏认为，人体感受风寒之邪，其传经的一般顺序是先由太阳经，传入阳明经，再入少阳经，然后依次传入太阴经、少阴经和厥阴经。但风寒之邪，不必定自太阳一经，六经皆可直接受寒邪而为病。“风寒中人，无有常经，是以伤寒不必定自太阳，中寒不必定自三阴。论中凡言阳明中风、阳明病若中寒及少阳中风、太阴少阴厥阴中风等语，皆是本经自受风寒之证，非从太阳传来者也。”进而尤氏提出“六经皆能自受风寒，何必尽从太阳传入”的观点。此意在于：六经都能感受寒邪，不一定都是从太阳经传入；即使是从太阳经传入，也不一定都循经递进。这一见解是符合《伤寒论》原义的，同时也与临床实际相吻合，直中和传经确实有所区别，他的这一思想亦是受到后世医家的重视。