抗生素：筛选重组质粒

由于转化效率或连接效率并非100%，将质粒或连接产物转化进大肠埃希菌细胞后，还需对大肠埃希菌细胞进行药物筛选，通过这些药物来杀死没有转化成功的大肠埃希菌。最常使用的药物是抗生素类药物，如氨苄青霉素、卡纳霉素等。氨苄青霉素在细菌的对数生长期对抗细菌最有效，在静止生长期影响较小，通过抑制转肽酶的活性、抑制大肠埃希菌形成杆状结构等起作用。卡纳霉素对多种细菌具有广谱抗菌作用，可通过抑制细菌蛋白质的合成和增加诱发翻译错误的频率实现抗菌作用。(https://www.daowen.com)

如果所使用的质粒含有抗生素抗性基因，如抗氨苄青霉素的β-内酰胺酶和抗卡纳霉素的氨基磷酸转移酶，则单个转化菌落就可以分泌产生足够的β-内酰胺酶或氨基磷酸转移酶，灭活周围培养基中的抗生素，从而产生一个受保护的区域使转化成功的菌落可以生长。其他常用的抗生素还包括四环素、氯霉素、遗传霉素等。