质粒和PCR酶切产物的纯化实验

(二)质粒和PCR酶切产物的纯化实验

如果质粒酶切时选择的是单一酶切反应,且整个质粒上只有一个这种酶切位点,那么在酶切反应完成后就可以将反应产物直接进行纯化,不需要通过凝胶电泳后再割胶纯化的方式进行;如果质粒是双酶切,且两个酶切位点只有十几到几十个碱基距离,可以将反应产物直接进行纯化,不需要通过凝胶回收的方式。同样,如果通过PCR扩增而来的产物条带很特异,且只有目的条带一条、没有其他杂带,那么这个PCR产物可以直接进行纯化,不需要通过凝胶电泳后再割胶纯化的方式进行;纯化后的PCR产物在经过两个末端的酶切反应后,酶切产物可直接进行纯化,不需要通过凝胶电泳后再割胶回收的方式进行。另外,如果PCR扩增而来的产物条带很特异,只有一条目的条带,也可以直接进行酶切反应,反应后的产物直接用试剂盒纯化即可进行下一步的连接反应。下面以“普通DNA产物纯化试剂盒(DP204)”为例,说明质粒酶切产物、PCR扩增产物、PCR产物酶切反应后的直接纯化操作。

(1)吸附柱平衡:将吸附柱CB2放入收集管中,向吸附柱中加入500μl平衡液BL,12 000 rpm离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2重新放回收集管中。

(2)估计PCR反应液或酶切反应的总体积,向其中加入5倍体积的结合液PB,充分混匀。

(3)将所得溶液加入平衡好的吸附柱CB2中,室温放置2 min,12 000 rpm 离心30~60 s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2放入收集管中。

(4)向吸附柱CB2中加入600μl漂洗液PW(使用前需加入一定体积的无水乙醇),12 000 rpm离心30~60 s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2放入收集管中。(https://www.daowen.com)

(5)再次向吸附柱CB2中加入600μl漂洗液PW,12 000 rpm 离心30~60 s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2放入收集管中。

(6)继续12 000 rpm 离心2 min,尽量除去漂洗液。将吸附柱CB2放入一个干净的1.5 ml离心管中(可用剪刀提前剪去管子的盖子),室温放置2~3 min,彻底地晾干,以防止残留的漂洗液影响下一步的实验。

(7)向吸附柱CB2的膜中间位置悬空滴加30~50μl纯水,室温放置2 min。12 000 rpm离心2 min,即为纯化后的质粒或PCR产物酶切后的特定DNA片段。

(8)使用紫外分光光度计检测浓度和纯度,然后即可进行质粒和PCR产物的连接反应。