(四)质粒抽提
商品化试剂盒中,分为质粒小量提取、质粒中量提取、质粒大量提取3种类型。这3种试剂盒的操作原理完全相同,区别仅在于裂解的菌液总体积和抽提到的质粒总量不同。一般的酶切、测序、小规模的转染实验使用小抽试剂盒即可达到实验所需的量;如果质粒用来进行病毒包装和细胞感染,或实验中需要大量使用质粒,则选取大量提取且可去除内毒素的大提试剂盒进行。下面以“高纯度质粒小提试剂盒(CW0500S,50 preps)”为例,说明常规的质粒抽提操作过程。
(1)取1~5 ml过夜培养的菌液加入离心管中,13 000 rpm 离心30 s收集菌体沉淀,尽量吸弃上清液。
(2)向留有菌体沉淀的离心管中加入250μl Buffer P1(确保P1中已加入Rnase A),使用移液器或涡旋振荡器充分混匀,悬浮菌体沉淀。
(3)向离心管中加入250μl Buffer P2,温和地上下颠倒混匀4~6次,充分混匀使菌体裂解,此时溶液应变得清亮黏稠。不要剧烈震荡,以免打断基因组DNA,造成提取的质粒中混有基因组DNA片段。
(4)向离心管中加入350μl Buffer N3,立即温和地上下颠倒混匀8~10次,充分混匀,此时应出现白色絮状沉淀。13 000 rpm 离心5 min。(https://www.daowen.com)
(5)将步骤4中所得上清液转移到已装入收集管的吸附柱中,13 000 rpm 离心30 s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
(6)向吸附柱中加入150μl Buffer PB,13 000 rpm 离心30 s。
(7)向吸附柱中加入400μl Buffer PW(确保其中已加入无水乙醇),13 000 rpm 离心1 min,倒掉收集管中的废液。
(8)将吸附柱置于一个新的离心管中,向吸附膜的中间部位加入50~100μl的无菌H2 O,室温放置2 min。13 000 rpm 离心1 min,将质粒溶液收集到离心管中,-20℃长期保存。