TALEN的识别

TALEN 元件通常识别的是14～20 bp的特异性DNA序列。TALEN蛋白的中间部位有一种特殊的重复序列（RVD），它是DNA 结合结构域的重要组成部分，是长的重复序列，具有特异性识别并特异性结合DNA序列的特性。不同的RVD特异性识别A、T、C、G 四种碱基中的一种，这是TALEN识别DNA的关键机制。研究发现，天然的TALEN 有20多种不同的RVD，其中有4种RVD，His／Asp（HD）、Asn／Gly（NG）、Asn／Ile（NI）和Asn／Asn（NN）占总量的3／4。其中，NI识别碱基A，HD 识别碱基C，NG 识别碱基T，NN 识别碱基G／A。RVD稳定结构是通过第一个氨基酸与蛋白质骨架结合；从第二位氨基酸开始结合DNA 序列实现对特定DNA碱基序列的识别。此外，研究人员还发现，天然TALEN 靶标DNA 序列5′端保守跟随着一个T碱基，故靶序列总是以T碱基开始。通过这些结构，我们能够根据试验目的设计DNA结合域的重复序列，从而获得具有特异性识别目标靶点的TALEN。(https://www.daowen.com)