DNA片段检测
2026年07月08日
(四)DNA片段检测
在细胞凋亡的后期,Caspase会激活Caspase-Activated Dnase(CAD),切割核小体之间的DNA,形成以180~200 bp为单位的DNA片段,经琼脂糖电泳后形成DNA ladder。
1.操作步骤
(1)收集细胞(1×107个细胞),离心沉淀,弃上清液。
(2)加入细胞裂解液,裂解细胞。
(3)13 000 g,离心5 min,收集上清液到1.5 ml离心管。
(4)加1%SDS和RnaseA(5 mg/ml),56℃,孵育2 h。(https://www.daowen.com)
(5)蛋白酶K(2.5 mg/ml)37℃,孵育2 h。
(6)加入1/10体积3 M 醋酸钠(p H 5.2)和2.5倍体积的冷无水乙醇沉淀DNA,4℃过夜。
(7)13 000 g,离心15 min,保留沉淀DNA。
(8)最后将沉淀溶解在TE buffer中,加DNA Loading Buffer。
(9)制备1.2% 琼脂糖凝胶,跑DNA电泳,拍照。
2.注意事项 电泳时一定要注意换用新鲜配制的电泳液,DNA 凝胶也要用新鲜配制的电泳液配制并新鲜配制后使用。电泳时为获取最佳的电泳效果使ladder充分分开,电泳速度宜适当慢一些,凝胶宜适当长一些,而加样孔宜更加扁平一些。选取适当较薄的梳齿,往往会获得更好的ladder电泳效果。