建立坚强的一元化领导
任弼时指出：这次高干会最大的一个收获，就是因为它不是在许多现象里兜圈子，而是深入到思想领域中去解决问题，去求得党内思想上的一致，使我们边区的党，在思想上奠定了领导一元化的基础。这次会议以后，以西北局为核心的一元化领导，在边区应该是能够很巩固地建立起来的。[50]
今后西北局的领导工作，首要的任务就是掌握思想上的领导，继续这次高干会着重检讨思想问题的精神，更加努力于达到西北党在思想上的完全一致，克服存在着的和可能生长的一切不正确的思想和倾向，这是第一个要务。其次要抓紧当前边区工作的重要环节，就是努力发展生产建设事业，并注意干部的学习领导，用全力研究与掌握围绕着这个中心环节的各项政策，以指导全西北党政军民各种工作，并组织这些政策的贯彻执行。[51]
西北局以下的各级党政军民关系，也要建立健全的以党为中心的一元化领导。边区党各级的干部，必须忠诚地服从西北局的领导，为坚决执行西北局的每一个决定而奋斗。对于某些仍然继续闹独立性的同志，须严申党的纪律。西北局是党中央的代表机关，西北的每一个党员、每一个党的组织，只有爱戴西北局，坚决执行西北局的决定，才能表示他们真正是拥护党中央的正确路线，真正是爱戴党的中央和党的领袖——毛泽东同志。[52]
在西北局高干会议期间，边区政府主席林伯渠关于“三三制”政权中党的领导问题指出：在“三三制”政权中，党一定要领导，一定要在政治上占优势。没有党员不行，党团一定要受党领导，党员一定要受党团领导，绝对不许可党员随随便便闹独立性。那种认为“三三制”是各阶级、各党派的互相制约，说党不要多干涉，党的意见不一定能代表人民，党员有无、多少没有关系等等意见，是错误的。党员目中无党，自己要说啥就说啥，要做啥就做啥，是绝对不许可的。[53]
为了纠正存在的偏向和问题，会议在组织上做出四点决定：其一，边区一级的党政军民工作都统一于西北局领导；其二，更加密切军队与地方的关系；其三，要克服党政军民各部门本身组织关系上存在的问题；其四，整顿党的组织，重新登记党员。为此，党、政、军三方面分别召开了地委、县委书记联席会议，专员、县长联席会议和军政干部会议，根据会议精神分别讨论和布置了各部门的工作。
“九一决定”发布和西北局高干会议结束后，各个抗日民主根据地开始贯彻实施。1943年1月28日，中共中央华中局为贯彻党的领导一元化，要求党政军各级干部严格地痛快地清除宗派主义余毒，严守党的纪律，服从党的领导，每一军区、每一分区必须根据中央指示，承认一个比较优秀一点的同志为领导中心，并且把党的领导一元化，从各区党委贯彻到各地委以至各县、各区。[54]12月18日，彭德怀在太行区分局干部会上做《怎样继续坚持与巩固抗日民主根据地》的报告。指出：革命的武装、革命的政权、革命的群众组织、革命的政党——共产党（而且前面的三种组织都在共产党领导之下），这四种组织必须明确分工，而且必须在共产党统一的领导与计划下，对敌进行斗争。革命根据地的巩固不巩固、健全不健全，就决定于上述四种组织巩固不巩固、健全不健全。[55]