2017年
1月8日，福建省人民政府依托附属二院建设福建省呼吸医学中心。
1月18日，召开第二次党员代表大会，选举产生第二届党委委员和纪委委员。
3月21日，重症医学科荣获“全国五一巾帼标兵岗”称号。
4月，曾奕明、吕国荣入选2015—2016年度“中国名医百强榜”。同月，中国残疾人康复协会康复工程与辅助技术专业委员会视障辅助技术专业学组成立并挂靠附属二院，胡建民博士任组长。
5月，国家卫计委办公厅、中国中医药管理局办公室、中央军委后勤保障部卫生局组织对优质护理服务工作中表现突出的集体和个人进行通报表扬，泌尿外科获评“优质护理服务表现突出的病房”，泌尿外科苏晓萍护士长获评“优质护理服务表现突出的护士”。
5月15日，医院通过国家药物临床试验资格认证。
7月1日，医院作为福建省呼吸医学中心加入并成为国家呼吸临床研究中心·中日医院呼吸专科医联体单位。
7月15日，生殖医学科首例取卵移植“试管婴儿”诞生。
7月20日，泉州市委书记、市人大常委会主任郑新聪率队实地察看了医院东海院区及在建核心病房楼项目。
8月23日，福建省政府给予福建省第七批援藏、第六批援疆和第九批援宁工作队各记集体二等功一次。医院神经外科行政副主任、主任医师黄金钟和麻醉科副主任医师刘炜烽榜上有名。
9月，曾奕明教授当选为中华医学会呼吸病学分会介入学组副组长，陈晓阳博士当选中华医学会呼吸病学分会青年委员。
9月15日，医院通过中国胸痛中心认证工作委员会认证，正式成为中国胸痛中心认证的成员单位。
9月28日，医院荣获“2016年度全国脑卒中高危人群筛查与干预项目先进集体”。
10月，放射科通过中华医学会骨质疏松与骨矿盐疾病分会颁发的骨密度测量（DXA）质量控制合格认证。
10月21日，超声医学科吕国荣教授在医疗“人机大战”中获胜，成为全场唯一一个战胜AI（人工智能）计算机的专家。
11月2日，医院免疫学和变态反应专业、皮肤病专业、超声诊断专业列入2017年省级临床重点专科。
11月10日，中国辅助技术研究所视障辅助技术研究中心落户附属第二医院。
11月14日，医院举行泉州市高速公路交通事故空地立体化医疗救援演练暨泉州航空医疗救援启动仪式。
11月18日，医院成为中国医师协会呼吸内镜医师培训基地。
11月23日，医院通过中国妇幼保健协会“母婴友好医院”评审。
11月24日，医院获得国家药品不良反应中心哨点医院授牌。
11月25日，医院获中国糖网筛防中心授牌。
12月13日，生殖医学科人类辅助生殖技术通过国家卫计委评审正式运行。
12月14日，医院获国家卫生计生委脑卒中防治工程委员会“高级卒中中心”。
12月27日，医院获全国首批“中国心衰中心建设单位”。
12月30日，国家卫生计生委通报表扬“2015—2017年改善医疗服务先进典型”，医院获“和谐关系示范医院”称号，团委获“人文关怀示范科室”称号，曾奕明院长获“和谐关系示范个人”称号。