保卫科建科之前，安全保卫工作由人事科承担。
按照相关文件要求，1984年，医院成立保卫科。
2013年，保卫科更名为保卫处。
2014年，两院区分别设立保卫处办公室（东海院区筹建开始时，抽调保卫人员参与前期建设工作），并于2015年1月开始全面接管东海院区保卫工作。
2020年5月，保卫处主体办公区搬迁至东海院区。
