二、个人荣誉
2003年，曾奕明《肺泡灌洗液聚合酶链反应诊断肺部巨细胞病毒感染价值》获泉州市第三届优秀自然科学论文一等奖。
2004年，曾奕明团队获医院首个省部级科技二等奖（福建省科学技术奖）；吕良超获全省卫生系统先进工作者。
2007年，曾奕明获“国务院特殊津贴专家”荣誉。
2009年，张华平获“泉州市优秀公务员（公职人员）”称号；陈云峰获“泉州市青年岗位能手”称号。
2013年，张华平获“福建省传染病疫情及突发公共卫生事件报告管理先进工作者”称号；陈晓阳获2013年获福建医科大学“师德先进个人”称号。
2014年，曾奕明入选《中国名医百强榜》（介入呼吸病学十强）；张祎祥获中华医学会呼吸病学分会年会优秀论文奖；张华平获福建医科大学“优秀共产党员”称号；林辉煌及护理团队获医院医疗护理知识竞赛一等奖及团体一等奖、优质护理剧本汇演三等奖。
2015年，曾奕明再次入选《中国名医百强榜》（介入呼吸病学十强），并获泉州市科技领军人才奖；在福建医科大学附属第二医院青年教师讲课比赛中，林辉煌获一等奖。
2016年，曾奕明获中国医师协会“第十一届中国优秀呼吸医师奖”，并获福建省卫生计生突出贡献的中青年专家荣誉称号；陈云峰获中华医学会第5届全国呼吸内镜和介入呼吸病学学术研讨会优秀壁报奖；吴炜景获福建省共青团“福建省青年岗位能手”、福建医科大学“优秀共产党员”；陈晓阳获评福建医科大学优秀桥梁课授课教师；林辉煌在2016年福建医科大学附属第二医院青年医师技能比赛中获个人比赛第一名；林辉煌、施丽泳获团体比赛第一名；林辉煌还获福建医科大学附属第二医院青年教师讲课竞赛一等奖。
2017年，曾奕明获“国家卫生计生委突出贡献的中青年专家”“福建省科技创新领军人才”称号；张华平获“泉州市优秀健康卫士”称号；张华平获2017年中华医学会呼吸病学分会年会优秀壁报奖；陈晓阳荣获中华医学会全国变态反应学术会议亚太过敏科学论坛上优秀报告奖；杨栋勇、林辉煌获宋庆龄基金会主办的新“镜·介”再检医技大赛上饶初赛团体一等奖；王银凤、黄琳琳获得福建医科大学附属第二医院青年医师临床岗位技能竞赛团体二等奖，并分获技能操作项目第一、二名；樊冀闽医师获福建医科大学临床医学部青年教师讲课比赛特等奖、福建医科大学青年教师讲课比赛二等奖、福建医科大学优秀青年教师。
2018年，曾奕明团队再次获福建省科学技术奖二等奖。
2018年，林辉煌获“国际呼吸病学会和美国胸科学会联合会” ISRD青年奖；施丽泳获得中华医学会呼吸病学分会青委会主办的“呼吸慢病管理全能挑战赛”闽赣区域赛一等奖、全国半决赛“优胜奖”、全国总决赛季军；陈云峰获中华医学会呼吸病学年会优秀论文奖；林晓萍获第十五届中青年呼吸学者论坛优秀论文奖；张祎祥获《中国实用内科杂志》主办的“抗感染态度说”福建赛区一等奖、南中国半决赛优秀奖；张祎祥、林辉煌分别获念珠菌感染诊疗思路PK赛闽西南赛区一、二等奖；蔡绵绵、王幼绢、黄爱真等人在华东六省一市护理学术交流会上获优秀论文奖；林晓萍获福建省“青年文明号”优秀号长；陈云峰、林晓萍获福建医科大学附属第二医院“十佳青年医师”奖；施丽泳获福建省医学会呼吸病学分会主办的首届PCCM学员英语演讲比赛三等奖。
2019年，曾奕明第三度入选《中国名医百强榜》（介入呼吸病学十强）；曾奕明获首届中国介入呼吸病学临床转化创意大赛二等奖；陈晓阳获首届中国介入呼吸病学临床转化创意大赛三等奖；张祎祥获闽赣第一届念珠菌诊疗思路赛冠军，林辉煌获三等奖；陈妙香获中华护理学会全国呼吸护理新进展学术交流会辩论赛二等奖；杨娇鸿、樊冀闽、黄丽媚获中国睡眠医学执业技能大赛团队优秀奖；苏焕章在中华医学会呼吸病学年会上获优秀论文奖，翁美丽获优秀壁报奖；柯智元、胡安可获中华医学会第六届全国睡眠呼吸疾病学术会议优秀论文奖；施丽泳获中国医师协会呼吸医师分会年会暨十八届中国呼吸医师论坛优秀病例奖；丁锦珍、杨凤英、陈淑超选送的肺康复病例在中国康复医学会肺康复病例比赛中进入全国十强；陈云峰获首届中国医师协会介入呼吸病工作委员会年会“呼吸介入视频比赛”一等奖、华东六省一事介入呼吸病学协作组年会呼吸介入手术视频大赛三等奖；宋端虹护师获首届中国医师协会介入呼吸病工作委员会年会“呼吸介入视频比赛”优秀奖；林辉煌获国家卫健委原管理研究所主办的第十三期《细菌枕巾感染诊治培训项目（培元计划）》优秀学员奖；李雅璐在福建医科大学巨型的“深入学习慕容慎行同志先进事迹”征文活动中获优秀奖；张祎祥副主任医师在临床危重症感染思维提升MDT训练营闽赣赛区胜出进入全国决赛，并获福建医科大学临床医学部青年教师教学基本功比赛三等奖；黄琳琳获福建省第二届PCCM学员英语演讲比赛三等奖；林辉煌在福建医科大学附属第二医院中国医师节系列活动中获福建医科大学附属第二医院“十佳青年医师”奖；施丽泳、王银凤团队获“健康好声音”健康知识宣讲比赛一等奖；吕辉迎、杨娇鸿在三基技能竞赛中获团体二等奖；陈妙香、谢巧玲在福建医科大学附属第二医院护理操作竞赛中获个人二等奖，吴惠芬、杨凤英获个人三等奖，陈妙香三人组获团队第一名。
2020年，张华平获福建省“抗击新冠肺炎疫情先进个人”、福建省“优秀共产党员”称号；陈晓阳、张祎祥、黄秋婷、陈妙香被武汉金银潭医院和福建省首批援鄂医疗队评为“先进个人”。陈晓阳获2020年福建省五一劳动奖章，以及福建医科大学“十佳医师”“优秀教师”“抗疫先进个人”称号；吴炜景获2020年福建省“最美医师”、福建医科大学临床医学部“优秀教师”、福建医科大学附属第二医院“十佳青年医师”称号；张祎祥获福建省“抗疫最美家庭”称号、福建医科大学“抗疫青年先锋”称号；樊冀闽、陈云峰获福建医科大学“抗疫青年先锋”称号；陈妙香获福建省“最美护士”、福建省“最美劳动者”称号；蔡绵绵获泉州市“三八红旗手”、武汉市金银潭医院“荣誉职工”、福建医科大学“抗击疫情青年先锋”、2020年福建省“抗击新冠肺炎疫情先进个人”、2020年度福建省“抗疫最美家庭”、2020年新时代“最美逆行者”称号；林素珠获武汉市金银潭医院“荣誉职工”、2020年福建医科大学“青年突击队援鄂抗击疫情青年先锋”、2020年“最美逆行天使”、2020年度福建省“抗疫最美家庭”、2020年新时代“最美逆行者”；黄燕青、许翠玲、陈丽玲获武汉市金银潭医院“最美职工”、福建医科大学附属第二医院“最美逆行者”称号。丁锦珍获福建省医学会第二十次呼吸病学术会议优秀论文奖。
2021年，陈晓阳获评2016—2019年全省卫生健康系统先进工作者。