福建医科大学附属第二医院团委,是先进青年的群众性组织,作为党的助手和后备军,肩负着团结和教育全院广大团员青年,发挥党联系青年的桥梁和纽带及创造性地开展工作的职能。现有团员(含临床学院学生及28周岁以下保留团籍党员)1000多人。目前,团委下设8个在职团支部、1个学生团总支(下设2个学生团支部),在职团干部42人。