20世纪80年代末，医院成立中共福建医科大学附属第二医院纪检监察组。
90年代初，成立中共福建医科大学附属第二医院纪委、纪检监察室。
2014年，监察室更名为监察处。
2020年3月，纪检监察机构改革，设立纪委综合室和纪委监督室。
1992年3月，吴顺荣任纪检监察组组长。
2000年1月，欧阳章团任福建医科大学附属第二医院纪委书记。
2010年11月，刘惠民任福建医科大学附属第二医院纪委书记。
2021年6月，黄淑忠任福建医科大学附属第二医院纪委书记。
