一、机构变革

1956年—1957年，医院筹建病理科。

1958年1月，病理科正式开业，科室设在原医院天桥南侧2层（原五官科病房），面积约150平方米，有医师1名、技术员2名。

1978年，病理科迁至旧门诊楼3层沿街侧（威远楼边），共有8间，面积约200平方米，有医师2名、技术员2名。

1983年，病理科迁至内科楼（4号楼）3层东侧，共8间，面积约250平方米。

1992年，病理科建立免疫组化室开展免疫组织化学染色技术。

1998年，科室迁至门诊楼七层北侧共15间，面积约450平方米，设取材室、细胞与冰冻室、免疫组化室各1间，制片室4间，诊断室、资料室各3间，图文文档室、库房各1间；有主任医师2名（含返聘1名），主治医师2名，住院医师1名，主管技师2名，技师1名，技士1名。

2009年，病理科扩大工作间10平方米用于细针穿刺室；调整、规范病理污染区；增设一间分子病理室开展FISH、原位杂交技术。

2011年，病理科成为福建医科大学8个“临床医学（临床病理学方向）”专业本科实习基地之一；开始筹备建设亚专业组。

2015年1月，东海院区一期病理科设立，设取材室、技术室、诊断室、资料室、库房、值班室各1间，面积约160平方米，主要开展术中冰冻快速诊断。

2020年10月，东海院区一期病理科冰冻室搬迁到核心病房楼（8号楼）4层新病理科冰冻室；鲤城院区新增4间资料室面积约50平方米，位于儿科旁边沿街原动物房，用于存放2014年前的病理蜡块、切片及纸质资料。

2021年1月，病理科主体搬迁至东海院区核心病房楼（8号楼）4层西侧，面积1000余平方米，包括三部分：常规病理区，面积近900平方米，分清洁区（服务前台、男女更衣室、医师办公室、教学与会诊室、病理资料暂存室等）、轻污染区（组织制片室、免疫组化室、FISH室等）和重污染区（标本接收与贮存室、冰冻切片室、取材与脱水室、细胞室）及其他（试剂库房、普通库房、男值班室、女值班室等）；分子病理室，面积120平方米，包括PCR实验室；尸体剖检室面积约30平方米。