第一节 发展概况
医务部是医院主要的职能部门，在医院党政领导下，具体组织实施全院的医疗工作，处于医院医疗管理运行的“枢纽”位置。创科至今，随着医院各个发展时期任务的变化，医务部职能及其机构设置、工作方式也相应地调整和变化。
惠世医院设立医务部门或专人管理医务职能工作始于20世纪20年代末期，当时聘请了吴祝三、郑辉昇两位医生协助叶启元院长管理医务工作，此后的各任院长均有指派1～2位医生专管医务工作。
从1942年兰大弼担任院长开始，医务主任就由院长兼任，直至医院被政府接办。20世纪40年代，医院进入规范化的现代管理体制，医务人员增多，各临床医技科室均设立科主任，医院在董事会领导下由院长负责管理，并采取院科两级管理模式。
20世纪30—40年代，鼠疫、霍乱、天花、疟疾、性病等传染病高发，积极开展传染病防治工作，1940年启用隔离病院。中华人民共和国成立后，医院认真贯彻预防为主的方针，深入、持久开展以消灭天花、鼠疫、霍乱等烈性传染病为中心的爱国卫生运动。
1954年5月，医院重设组织机构，设立医务处。同年，组织下基层普查、防治地方病、流行病。
1958年，医务部更名为医务科，其后在一系列政治运动中调整设置。同年，组织血丝虫普查及蛔虫普查。
“大跃进”运动开始至“文化大革命”初期，医务科定期组织医疗队下乡巡回医疗，指导发展南安、安溪、永春、德化等县医院的医疗技术业务；抽调医务人员支援永春县医院和安海医院的医疗业务工作；固定在德化县赤水保健院设立下乡医疗中心点。
1961年，医务科建立和巩固各种有效的医疗制度；1962年，组织医疗队在南安英都、石井两区进行食道癌普查。1963年，加强“三基”（医疗、技术、制度）工作，贯彻计划生育方针，成立计划生育指导小组。
“文化大革命”期间，医院受到累及，一些医疗、护理工作制度受到破坏，教育、科研发展基本停顿。
1973年10月，作为福建医科大学附属医院，医务科重新组建，1978年正式复科，主要负责医疗、科研、教学、病案、公共卫生等内容。
20世纪70年代，在推广“一针一草”中草药防病治病群众运动的推动下，医院挖掘、继承和发展民间中草药经验；开办支农门诊，组派医疗下乡，前往张坂公社卫生院、崇武公社卫生院开展肿瘤普查，开展防病治病保健工作；开展农村妇女“两病”普查普治工作；创办《新医药通讯》杂志2期（佚失），与兄弟医院交流和推广经验；和解放军第180医院合作研究乙型肝炎抗血清治疗。
医院归属福建医科大学后，医务科负责其医学系临床教学的安排工作。1978年，开始有接收进修记载，迄今累计接收3000多人次来院进修学习。
20世纪80年代，医院设有科研动物实验室，各科室均有科研课题。医务科主要负责人参与福建省医学院卫生系的复办（1980年）、口腔医学系的设立（1984年），承担两系学生的临床教学和实习。1982年，医院被定为福建医学院卫生系临床教学基地，医务科负责组建7个教研室（内科学、外科学、妇产科学、儿科学、耳鼻咽喉科、放射诊断学、中医学等），后发展为福建医学院第二临床医学院。同时，担负晋江卫校医士班、护士班的临床教学工作。受省卫生厅委托，每年举办一期全省骨科医师进修班，招收7～10名学员。此外，作为本地区放射科、妇产科、五官科进修基地，每年接收各地区基层医院选送的学员进修。
为发挥医院素有的外科优势，适应改革开放的需要，1981年和1983年，经批准在本省率先建立华侨门诊和华侨病区，为华侨、港澳台同胞来院诊疗和健康检查提供便利和优质服务，广受赞誉。
进入20世纪90年代，医务科工作内容不断扩大、工作领域不断拓宽、工作内容不断增加，对医务科更好地发挥职能作用提出了新的要求。1993年，医务科主抓毕业住院医师“三基三严”培训。
1994年，帮助医院获评“爱婴医院”；同年，科教科独立设置。
1995年8月，医院加入福建省医学会，医务科负责主要业务往来。
医务科从1995年9月19日开始宣传动员，至1998年11月，帮助医院获得卫生部首批“三级甲等医院”称号，并于2007年、2010年顺利通过福建省卫生厅三甲复评。
为了进一步强化医务科工作执行力，医院优化和扩充机构，2000年成立医保办（后独立）。2004年，为加强院感控制管理水平，在分管院长及医务科的组织下，独立出院内感染科。
2005年5月，医院设立公共卫生应急办公室（简称应急办），与医务部协同办公。
2009年，医院成立医疗纠纷调解办公室，挂靠医务科。
2014年6月，医务科更名为医务部。
2015年1月，医务部增加东海院区办公室。
2019年8月，医务部主体迁往东海院区，鲤城院区医务部继续保留。