一、机构变革
（一）晋江专区第二医院建院初期
1952年，人民政府接收旧惠世医院、命名为晋江专区第二医院；20世纪50年代，也就是1953年5月—1959年6月，医院调整为外科医院及合并成专区医院外科部期间，临床科室只设置外科、妇产科、五官科等大外科系统，内科、儿科和传染病等系统合并到晋江专区第一医院；1959年6月，恢复综合医院建制后，重新设立内科。当时内科只有一个科室，位于旧惠世楼二层，病床40张左右，当时只能诊治常见的内科疾病，共有医师10余人，高秀惠护士长为内科负责人、黄静宜负责医疗业务。
1960年，肿瘤科、放射治疗科成立。
1965年，支农门诊设立。
20世纪60年代，内科应用牙痈草（一散灵）治疗急慢性肾炎，其论文收入《中药大辞典》及《福建省科学技术成果汇编》；在支农门诊开展中草药治疗各种疾病。
1971年5月—1976年1月，黄寿全、叶国梁、郭进德参加援助南也门医疗队。
1973年，大内科与五官科共同组成一支医疗队，到崇武及张坂两地开展早期食道癌拉网普查工作。
1976年，陈芯汶及蔡淑妹先后从妇产科调入内科；心电图室建立，多年后，脱离内科归属门诊部。
20世纪80年代初，内科吴连池及苏金针医师先后建立肠道门诊，数年后，肠道门诊独立，脱离内科归属门诊部；由内科医生吴佑生、万本颐，护士林淑温及附一院同位素室调入的蔡友杰医生共同建立独立科室——同位素室，归属门诊部。
20世纪80年代初，由内科医生王静意建立B超室，内科医生吕国荣研究生毕业后加入B超室，此后发展成现在的超声医学科。
（二）改革开放20世纪80年代
20世纪80年代初期（1981年），医院爱国楼（7号楼）落成启用，大内科搬迁至爱国楼，分为内一区（位于爱国楼3层）和内二区（位于爱国楼4层），大内科有所扩展，共90张床位，刚从青海医学院附二院心内科调来的吴景元主任担任内科行政主任，“文化大革命”后入学的医学院毕业生分配到内科，增添了大量的新生力量，为了把内科发展壮大，吴景元主任进行了全面的工作部署：实行总住院医师制度，开设了危重病监护病房，逐步规范了内科疾病诊疗工作和临床教学工作。
20世纪80年代中期（1985年底），大内科医师的诊疗工作开始专业化，医师分为：①心血管专业组，组员吴景元、黄子扬、杜心清、林荣等。②呼吸专业组，组员刘又荣、林玲等。③内分泌专业组，组员蔡墩保、陈国瑞、黄丽丽、施亚雄、李希圣。④消化专业组，组员黄好基、何秋玉、陈胜坚。⑤血液专业组，组员吴顺荣、吴永珍、潘敬新。⑥肾脏专业组，组员谢重荣、许有容、黄荣桂、曾奕明。⑦神经病学组，组员陈琦琦、杨东华、吴华强、林健康、林文凤、蔡若蔚等。
20世纪90年代初，大内科搬迁到供应室楼（4号楼），1层为内一科，设消化专业组、血液专业组、肾脏专业组和风湿免疫组；2层为内二科，设心血管专业组、呼吸专业组、内分泌专业组，同时收治中毒病人。