南都烧讨及平清盛愤死
承治四年（1180年）十二月十五日，平知盛传来了大破山本义经（源义经）的捷报。平氏一族士气大振，决意乘势一举平定恶僧之乱。
承治四年（1180年）十二月二十五日，藏人头平重衡领兵发往南都。然而，山本义经（源义经）败亡之后，恶僧的势力不减反增。《玉海》承治四年（1180年）十二月二十七日条记载：
河内地方，被寄官兵之处，为大众被射危，三十余人被打取了，其后被追归了。
然而，平重衡出兵之后，一改以往平氏对僧徒的顾忌态度，痛下狠手。僧徒一方虽然人多势众，也顿时溃不成军。
承治四年（1180年）十二月二十八日，东大寺、兴福寺两寺的禅房被大量烧毁。败亡的僧众逃往北方——这些人后来成为木曾义仲（源义仲）入京的向导。这也是平氏北部战线落败的导火索。
次年，即养和元年（1181年，七月十四日改元）正月十四日，高仓上皇驾崩，时年二十一岁。葬于清闲寺，谥号高仓院。
不久之后，平清盛也薨逝。《愚管抄》记载：
源义仲
平相国入道（清盛），同（承治）五年（养和元年，即1181年）闰二月五日，热病愈重，不久薨逝。
《皇帝纪抄》记载：
大相国禅门（平清盛）病恼，才六七日薨。
可见平清盛之死事发突然，想必平氏一门也措手不及。
养和元年（1181年）三月十日，此前出征讨伐源氏的平重衡、平维盛、平通盛、平知度、平忠度等官军，在尾张国洲俣河附近与源行家对战获胜。源行家仓皇败走。捷报传到京师时，一方面因为京城附近的僧乱已经平定，可以暂享太平，另一方面，根据《玉海》《皇年代略记》等记载，当时水旱虫害等自然灾害导致饥荒饿死，无法提供军粮，所以朝廷不再向外发兵征讨。
养和元年（1181年）八月，朝廷下旨任命藤原秀衡为镇守府将军，征讨源赖朝。并任命越后国城四郎平资长为越后守，征讨源义仲。
藤原秀衡
养和元年（1181年）八月十六日，平通盛被任命为大将军、平知度等为副将军，一同征讨源义仲。伊势守平清纲则奉命征讨源赖朝。