按照渝万铁路公司和勘察设计单位签订的供图合同规定的时间,施工图审核单位在规定的审核时限内完成了相关工程的审核,并提交了相关审核报告。设计单位对审核意见逐条进行了回复。部分审核意见被直接采纳;部分审核意见存在暂时的分歧,设计单位和审核单位通过充分讨论和沟通,最终达成了一致意见。这些审核意见在正式施工图中得到了贯彻和执行,从而进一步修改和优化了施工图设计。