崇尚理学，本于阴阳

张景岳处于宋明理学盛行的时代，因而深受其影响，曾言“医者，理也，理透心明斯至也”。以理学观点指导《内经》研究的特色体现于其著作中。如《类经》的分类编排受到理学创始人之一——周敦颐的《宇宙生成论》思想的影响，前三类分别为摄生类、阴阳类、脏象类。摄生类居首位，因其合乎天道，“夫人之大事，莫若死生，能葆其真，合乎天矣”（《类经·自序》）；阴阳类“生成之道，两仪主之”，居第二位；脏象类“人之有生，藏气为本，五内洞然，三垣治矣”而居第三，五藏对应五行。而《宇宙生成论》中说，“无极而太极。太极动而生阳，动极而静；静而生阴，静极复动。一动一静，互为其根。分阴分阳，两仪立焉。阳变阴合而生水、火、木、金、土。……化生万物”。太极生阴阳，阴阳化五行，景岳依据《宇宙生成论》中太极、阴阳、五行的顺序将《类经》前三类列为摄生、阴阳、脏象。可以看出《类经》的分类有借鉴《宇宙生成论》之处。

张景岳重视气的作用，对《内经》的注释便体现了他的重气思想。如《类经·摄生类》言，“夫生化之道，以气为本，天地万物莫不由之。故气在天地之外，则包罗天地，气在天地之内，则运行天地……人之有生，全赖此气”，认为气化万物，而人之生机赖于此气。这一重气思想不仅受《内经》中关于气理论的影响，而且受理学中气本论的影响，气本论认为气构成万物。万物生成之道由阴阳两仪所主，气生阴阳，阴阳化五行，五行化万物，万物虽由气所化生，亦本于阴阳。