Chelex-100提取法
当检验要求对DNA的模板质量要求不高时,可以用Chelex-100提取方法提取DNA。Chelex -100是一种化学螯合树脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成。含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,能螯合多价金属离子,尤其是选择性螯合二价离子,比普通离子交换剂具有更高的金属离子选择性和较强的结合力,能结合许多可能影响下一步分析的其他外源物质。通过结合金属离子,还可以防止DNA降解。通过离心除去Chelex颗粒,使这些与Chelex-100结合的物质与DNA分离,防止这些抑制剂或杂质带到PCR反应中,影响下一步的DNA分析。Chelex-100提取方法中,细胞DNA一直在同一管中进行操作,不涉及转移,因此检材的损失率低,是一个十分简单、快速的方法。但底物、核膜及其他试剂一起保留下来,DNA纯度比有机溶剂提取法低。Chelex-100方法将DNA双螺旋打开,不能用像EB染料插入方法进行定量分析,只能用杂交方法进行定量。Chelex-100法只适用于PCR分析,而不适合于RFLP分析,而且对于目的片段大于500bp的基因座的扩增成功率低。利用Chelex-100提取的DNA模板在复合扩增中存在各位点扩增不平衡的现象。
【基本步骤】
用无菌蒸馏水浸泡检材裂解细胞,通过离心收集沉淀,用浓度为5%的Chelex-100悬浮液悬浮沉淀中的细胞核,在56℃保温30min左右,剧烈振荡后,100℃保温8min,以裂解细胞核,释放DNA,同时使蛋白质变性成为不溶物,最后离心除去与金属离子结合的Chelex颗粒和其他非DNA成分(如蛋白质)。DNA留在上清液中,可直接用于随后的分析。56℃保温时向溶液中加蛋白酶K,可增加裂解的效率。
Chelex-100会随时间的延长被破坏,释放出以前结合的抑制物,因此用Chelex-100提取的DNA如果需要长期放置,应当把上清液与Chelex-100颗粒分开,保存在-20℃,以备以后分析。Chelex-100结合效果依赖于悬浮液pH值。5%Chelex-100的pH值在10.0~11.0为好。如果发现悬浮液的pH值不在此范围内,则应废弃。5%Chelex-100悬浮液最好现用现配,因为Chelex-100在数小时后螯合力有下降的趋向。