通过分析近几年的水质监测数据，可以看到，入库河流的氮、磷等营养盐含量均高于出库的氮、磷含量，在考虑水体自净能力不变的前提下，即使出入库水量持平，密云水库水体的营养盐含量也将不断增加。如果未来密云水库蓄水量没有较大幅度的增加，库区水体的自净能力就不会明显提高，而两条主要入库河流的氮、磷含量没有显著降低，未来密云水库的营养盐含量仍然会持续上升，水质状况将会呈现下降的趋势。
