除日常规律性运行变化外，污水处理厂还会遇到各种特殊运行状态。如：降雨时大水量低污染浓度、节假日低水量、配合市政施工降水、异常水质、异常停电、沼气管线泄露等极端情况，需要制定详细的运行调整方案来应对。对于可预见的异常情况，应制定提前进行工艺调整的准备方案，如改变生物池污泥浓度、污泥负荷、停留时间等，减少异常情况对生物系统的冲击；对于不可预见的异常情况，应制定采取紧急措施和恢复生物系统的调整方案。
