（一）实验室检查
尿检查在肾结核的早期诊断中占有重要地位。多数肾结核患者尿呈酸性，尿蛋白多为±～+，常有脓尿和镜下血尿。据我们的资料，尿常规有异常者达90%左右。尿常规检查是早期筛选肾结核的重要线索。如尿急、尿频、尿痛的患者，有镜下脓尿而普通培养未发现阳性致病菌，临床医师应高度怀疑肾结核的可能性。
1. 24小时尿沉渣找抗酸杆菌
抗结核治疗前多次检查，阳性率可达70%。但应注意，耻垢杆菌易污染尿液导致假阳性，故不能依靠一次阳性结果，尤其不能依靠找到几条抗酸杆菌便确定诊断。故阳性仅有参考价值，不能作为确诊依据。
2.晨尿培养结核菌
晨尿中培养出结核杆菌对早期确认肾结核有重要价值。一般认为，结核菌向尿中的排泄是间歇性的，应在抗结核治疗前至少留3次晨尿做结核菌培养，阳性率达80%～90%。对早期诊断有重要价值。有些学者提出应收集6次晨尿送检。
3.腹部平片（KUB）和胸片
腹部平片对肾结核诊断价值较小。有时可见肾实质钙化，在多数病例，钙化呈斑点状或不规则形。可沉积在部分或全部干酪性病灶区。晚期整个肾脏钙化（肾自截）。此外，胸片有时可见到陈旧性肺结核。
4.静脉肾盂造影（IVP）
疾病的早期可完全正常，然而，随着病变的进展，IVP可在63%～90%的病例中发现异常。最先出现肾盏变钝，随后是肾乳头小空洞形成，干酪性病灶内可有散在性的钙化影。输尿管狭窄及“腊肠状”“串珠样”特征性改变。其他还可见到肾集合系统狭窄、皮质疤痕和充盈缺损等。晚期可见整个肾脏钙化，多个肾盏不显影或呈大空洞。IVP发现空洞形成和尿路狭窄，为诊断肾结核的强有力依据。
5.逆行肾盂造影(https://www.daowen.com)
患者肾功能受损，IVP显影不佳或IVP有可疑病变，必要时可考虑逆行肾盂造影。
6.超声波检查
近年来，许多文献报道，尿路造影发现有广泛肾脏改变时，超声波检查却正常。故有些作者认为，超声波正常而尿路造影不显影者，应考虑肾结核的可能。因为本检查没有特异性，对可疑肾结核病例，不常规地应用超声波检查。利用超声引导，细针穿刺抽吸坏死组织和脓腔，进行细胞学、细菌学检查对诊断有帮助。
7.计算机体层摄影（CT）
CT对肾结核的诊断有重要意义，可提供病肾的结构和功能的资料，并有助于肾结核、肾肿瘤和肾上腺肿瘤的鉴别。CT对诊断肾内播散和肾周围脓肿亦有重要价值。
8.同位素检查
核素扫描可了解肾实质病变、肾功能，有助于估计治疗反应和判断肾脏功能。肾图检查对轻度病变显示供血不足曲线或排泄延长曲线，严重破坏则显示无功能的水平线，对肾盂积水则显示梗阻积液曲线。
9.其他
病变累及膀胱时，膀胱镜可见膀胱黏膜小溃疡和结节等，多在患侧输尿管口附近。血沉可增快，结核菌素纯蛋白衍化物（PPD）皮肤试验常阳性，尿结核菌抗体测定（PPD-IgG）阳性，表示有过结核感染，均可作为筛选试验之一。PCR技术利用尿液可快速检测出结核杆菌DNA，此方法敏感度高，但假阳性亦颇高。所以对实验室的条件和操作人员技能要求较高，否则易造成假阳性。