起源于汉代《伤寒杂病论》

方证的起源应追溯到《黄帝内经》，但汉以前各方证是零散的，不成体系的。汉代张仲景运用八纲、六经理论对方证进行系统归类和整理，才使其成为一个有序的整体，能够对人体病理状态进行全面综合的概括。因此，方证相应的理论基础来源于《伤寒杂病论》，即“病皆与方相应者，乃服之”。方证相应理论的形成奠定了方证辨证的基础，所谓“但见一症便是，小柴胡汤主之”。

仲景以方名证，方以药成，方药的功用体现治法，治法与病证相应，因此方药与病证呈直接的对应关系，即有是证必有是方，方证一体，如《金匮要略》中有用系列百合为主的方剂治疗“百合病”的记载。