小微企业发展势头迅猛，发展迅速，但其也存在着切实的税收问题。
第一，小微企业的税费负担重、优惠政策落实不到位。工信部中小企业发展促进中心于2013年发布的《全国企业负担调查评价报告》显示，74％的被调查企业反映税收负担比较重。
第二，企业自律性差也是小微企业在享受税收优惠政策方面的一大阻碍。小微企业在享受了税收优惠之后一旦被发现有在税务方面违规的行为，就要受到追回税款、罚款与交滞纳金三项处罚，很多小微企业觉得不值得冒这个风险去享受该优惠，一般会婉拒优惠政策。
